Костанайский областной филиал является структурным подразделением ТОО «Республиканская медицинская академия» на рынке образовательных услуг с 2013 года. Главная задача Филиала – создание необходимых условий для получения образования, направленных на формирование, развитие и профессиональное становление личности на основе национальных и общечеловеческих ценностей, достижений науки и практики, направлена на улучшение качества медицинских услуг посредством привлечения лучших специалистов Республики Казахстан, а также ближнего, дальнего зарубежья с применением новых технологий для проведения дополнительного профессионального обучения, подготовки, переподготовки и повышения квалификации медицинским и фармацевтическим специальностям с выдачей документов установленного образца.
Ежегодно на клинических базах в крупных медицинских лечебных учреждениях области проходят обучение около 2000 медицинского и фармацевтического персонала, согласно государственным стандартам дополнительного образования Министерства Здравоохранения Республики Казахстан. Занятия проводят кандидаты медицинских наук, врачи высшей категории, главные специалисты области имеющие большой практический и клинический опыт работы,. Для обучения высоким технологиям направляются слушатели на обучение в г. Астана и другие города Республики Казахстан в научные медицинские центры, кафедры медицинских академий.
Внедрено обучение медработников «Неотложным состояниям с применением симуляционных технологий» (сертификационный цикл) , а также для лиц без медицинского образования (парамедиков) с выдачей свидетельства, семинары, лекции, мастер классы; имеется электронная медицинская библиотека, обеспечиваем медицинской литературой по заказам слушателей;
По результатам ранжирования в СНГ филиал признан «Лидером сферы образования 2014 года». По итогам работы за 2016-2017 г. III место среди филиалов «РМА».